COVID-19: Genetische Netzwerkanalyse bietet ‚Momentaufnahme‘ der Pandemie Herkunft

Der erste Einsatz von phylogenetischen Techniken zeigen die ‚Vorfahren‘ Virusgenom in Fledermäusen die am nächsten nicht vorherrschenden Virus Typ Wuhan waren. Die Studie Chart des ‚beginnender Supernova‘ von COVID-19 durch genetische Mutationen, wie es aus China und Asien nach Australien, Europa und Nordamerika verbreitet. Die Forscher sagen, dass ihre Methoden zu Hilfe verwendet werden könnte, ohne Papiere Infektionsquellen zu identifizieren.

Durch die Analyse der ersten 160 vollständigen Virusgenome von menschlichen Patienten sequenziert werden, haben die Wissenschaftler einige der ursprünglichen Ausbreitung des neuen Coronavirus durch seine Mutationen abgebildet, die verschiedene virale Linien erzeugt.

„Es gibt zu viele Mutationen schnellen zu fein säuberlich einen COVID-19 Stammbaum zu verfolgen. Wir haben einen mathematischen Netzwerk-Algorithmus verwendet, um alle plausiblen Bäume gleichzeitig sichtbar zu machen“, sagte Genetiker Dr. Peter Forster, Hauptautor von der University of Cambridge.

„Diese Techniken meist bekannt für die Abbildung der Bewegungen der prähistorischen menschlichen Populationen durch DNA. Wir glauben, dass dies das erste Mal ist, dass sie verwendet wurden, um die Infektionswege eines corona wie COVID-19 zu verfolgen.“

Das Team verwendete Daten von Virus aus der ganzen Welt zwischen 24. Dezember 2019 und 4. März abgetastete Genome 2020. Die Untersuchung zeigte drei verschiedene „Varianten“ von COVID-19, bestehend aus Clustern von eng verwandten Linien, die sie ‚A‘ beschriften " B‘und 'C'.

Forster und fanden Kollegen, dass die nächste Art von COVID-19 mit dem in Fledermäusen entdeckt, Typ ‚A‘, das „Original-Genom menschlichen Virus“, war in Wuhan, aber überraschenderweise war nicht die vorherrschende Virus Typ der Stadt.

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Quelle: University of Cambridge. "COVID-19: Genetic network analysis provides 'snapshot' of pandemic origins." ScienceDaily. ScienceDaily, 9 April 2020. <www.sciencedaily.com/releases/2020/04/200409085644.htm>.