Die einde van gene: Roetinetoets onthul unieke divergensie in genetiese kode

Die genoom van 'n protis het 'n skynbaar unieke divergensie in die DNS-kode aan die lig gebring wat die einde van 'n geen aandui, wat die behoefte aan verdere navorsing voorstel om hierdie groep diverse organismes beter te verstaan.

Dr Jamie McGowan, 'n nadoktorale wetenskaplike by die Earlham Instituut, het die genoomvolgorde van 'n mikroskopiese organisme, 'n protis, ontleed uit 'n varswaterdam by Oxford University Parks.

Die werk was bedoel om 'n DNS-volgordebepalingspyplyn te toets om met baie klein hoeveelhede DNS te werk, soos DNS van 'n enkele sel. Dr McGowan het saam met 'n span wetenskaplikes by die Earlham Institute en met professor Thomas Richards se groep aan die Universiteit van Oxford gewerk.

Maar, toe navorsers na die genetiese kode gekyk het, het die protis Oligohymenophorea sp. PL0344 het geblyk 'n nuwe spesie te wees met 'n onwaarskynlike verandering in hoe sy DNA in proteïene vertaal word.

Dr McGowan het gesê: "Dit is blote geluk dat ons hierdie protiste gekies het om ons volgordebepalingspyplyn te toets, en dit wys net wat daar buite is, en beklemtoon hoe min ons weet van die genetika van protiste."

Dit is moeilik om enige uitsprake oor protiste as 'n groep te maak. Die meeste is mikroskopiese, eensellige organismes soos amoebes, alge en diatome, maar groter veelsellige protiste bestaan, soos kelp, slymskimmels en rooi alge.

"Die definisie van 'n protis is los, in wese is dit enige eukariotiese organisme wat nie 'n dier, plant of swam is nie," het dr McGowan gesê. “Dit is natuurlik baie algemeen, en dit is omdat protiste ’n uiters veranderlike groep is.

"Sommige is nader verwant aan diere, sommige nader verwant aan plante. Daar is jagters en prooi, parasiete en gashere, swemmers en oppassers, en daar is diegene met gevarieerde diëte terwyl ander fotosinteer. Basies kan ons baie min veralgemenings maak. "

Oligohymenophorea sp. PL0344 is 'n siliaat. Hierdie swemprotiste kan met 'n mikroskoop gesien word en word byna oral gevind waar daar water is.

Siliate is brandpunte vir genetiese kodeveranderinge, insluitend hertoewysing van een of meer stopkodons, die kodons TAA, TAG en TGA. In feitlik alle organismes word hierdie drie stopkodons gebruik om die einde van 'n geen aan te dui.

Variasies in die genetiese kode is uiters skaars. Onder die min variante van die genetiese kode wat tot dusver aangemeld is, het die kodons TAA en TAG feitlik altyd dieselfde vertaling, wat daarop dui dat hul evolusie gekoppel is.

"In byna elke ander geval waarvan ons weet, verander TAA en TAG in tandem," verduidelik dr McGowan. "Wanneer hulle nie stopkodons is nie, spesifiseer hulle elkeen dieselfde aminosuur."

DNS is soos 'n bloudruk van 'n gebou. Dit doen niks op sigself nie, dit gee instruksies vir werk wat gedoen moet word. Om 'n geen 'n impak te hê, moet die bloudruk "gelees" word en dan in 'n molekule ingebou word wat 'n fisiese effek het.

advertensie