COVID-19: Genetiese netwerk analise bied 'n momentopname 'van pandemiese oorsprong

Die eerste gebruik van filogenetiese tegnieke toon die "voorvaderlike' virus genoom naaste aan dié in vlermuise was nie Wuhan se oorheersende virus tipe. Die studie kaarte die "incipient supernova" van COVID-19 deur genetiese mutasies as dit versprei uit China en Asië na Australië, Europa en Noord-Amerika. Navorsers sê hul metodes kan gebruik word om hulp te identifiseer ongedokumenteerde infeksie bronne.

Deur die ontleding van die eerste 160 volledige virus genome word volgorde van menslike pasiënte, het die wetenskaplikes 'n paar van die oorspronklike verspreiding van die nuwe corona deur sy mutasies, wat verskillende virale afstammelinge skep gekarteer.

"Daar is te veel vinnige mutasies om netjies te spoor 'n COVID-19 stamboom. Ons het 'n wiskundige netwerk algoritme om al die waarskynlike bome gelyktydig visualiseer," sê genetikus dr Peter Forster, hoofskrywer van die Universiteit van Cambridge.

"Hierdie tegnieke is meestal bekend vir kartering van die bewegings van prehistoriese menslike bevolkings deur DNA. Ons dink dit is die eerste keer dat hulle is wat gebruik word om die infeksie roetes van 'n corona soos COVID-19 op te spoor."

Die span gebruik data van virus genome monsters van regoor die wêreld tussen 24 Desember 2019 en 4 Maart 2020. Die navorsing aan die lig gebring drie afsonderlike "variante" van COVID-19, wat bestaan ​​uit trosse van nou verwante afstammelinge, wat hulle etiketteer 'A', ' B "en" C ".

Forster en kollegas het bevind dat die naaste tipe COVID-19 aan die een ontdek in vlermuise, tipe A, die "oorspronklike menslike virus genoom", teenwoordig in Wuhan was, maar verrassend was nie oorheersende virus tipe die stad se.

advertensie

bron: University of Cambridge. "COVID-19: Genetic network analysis provides 'snapshot' of pandemic origins." ScienceDaily. ScienceDaily, 9 April 2020. <www.sciencedaily.com/releases/2020/04/200409085644.htm>.